Cell Electrophysiology Simulation Environment

Software screenshot:
Cell Electrophysiology Simulation Environment
Software ətraflı:
Version: 1.4.7
Tarixi Upload: 2 Jun 15
Geliştirici: Sergey Missan
Lisenziya: Pulsuz
Məşhurluq: 42

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

Mobil elektrofizyolojisi Simulation Environment (CESE) xüsusi misal üçün, hesablama elektrofizyolojik simülasyonları yerinə yetirmək üçün nəzərdə hərtərəfli çərçivə, ürək myocyte elektrik fəaliyyətinin simülasyonları.
Cell elektrofizyolojisi Simulation Ətraf fəaliyyət potensialı, fərdi ion axınları və ion konsentrasiyaları dəyişikliklər simülasyonları üçün faydalıdır.
CESE Java Runtime Environment (JRE) versiyası 1.4 və ya yuxarıda hər hansı sistemi çalışır, bir cross-platform proqram. Bu Windows, Linux, Solaris, MacOS X, və AIX üzrə test edilmişdir.
CESE istifadəçi
CESE elektrofizyolojik modelləri bir sıra istifadə edərək hesablama simülasyonları həyata keçirilməsi üçün vahid mühit.
Bu mərhələdə CESE yaradılması və (Hodgkin-Huxley (HH) və Markov cari resepturası də olan) birhüceyrəli modelləri icrası imkan verir. Mənbə kodu ilə ürək myocytes elektrik fəaliyyətinin modelləri CESE bölüşdürülməsi daxil edilir. Biz mövcud modellərin nömrəsi genişləndirmək və gələcəkdə müəyyən nöronal modelləri əlavə etmək üçün ümid edirik.
CESE əsas gücü onun eyni & # 65533 edir; bir proqram interface modelləri müxtəlif növləri üçün eyni olaraq qalır. Siz asanlıqla modelləri arasında keçid və simulyasiya nəticələr müqayisə edə bilərsiniz. Model parametrləri çıxış üçün seçilmiş və / və ya eyni standart şəkildə birləşmiş, dəyişdirilə bilər.
CESE "gərginlik bağlantısı" şərti elektrofizyolojik mənasını uzanır. Siz clamping əmrləri fərdi maraq model dəyişən üçün müəyyən kompleks parça-müdrik funksiyaları ola bilər və s. Gərginlikli (membran potensialı), o cümlədən faktiki olaraq hər hansı model dəyişən, ümumi və ya fərdi ion cərəyanlar, ion konsentrasiyaları, temperatur, gating dəyişənlərin, qısqac bilər . Bu kompleks model davranış kəşfiyyat üçün sonsuz imkanlar açır.
CESE sadə, lakin səmərəli data visualizations təmin edir. Simulation nəticələri qrafik və cədvəl formalarda təqdim edilə bilər. Sahələri xüsusi və faiz rayonlarında zoomed bilər.
CESE bir analiz alət üçün nəzərdə deyil, baxmayaraq ki, siz cari gərginlikli münasibətlər (I-Vs) yaratmaq və proqram çərçivəsində bir siqnal statistik parametrləri hesablamaq olar. Siz ASCII üçün məlumat ixrac edə bilər, Axon Mətn Fayl (ATF) və NetCDF formatları sevimli paketi təhlili davam edir.
CESE developers
Java developers ən yaxşı proqramlaşdırma təcrübə, həm istifadəçi interfeysi ardıcıllıq və kodu aydınlıq və təkrar baxımından daxil qədər CESE yerdən yaradılmışdır. Mümkün, CESE kodu asanlaşdırmaq üçün (məsələn Java2D, JavaBeans, JAXP üçün) mövcud Java API əsaslanır.
Model yaradılması Məişət kodlu olmalıdır funksiyaları & # 65533 bir sıra tələb edir; Bu konkret ion cari (s) üçün kod yazı üzərində bilər, beləliklə, CESE s simulyasiya nəticələri görselleştirilmesi bu routines üçün həyata keçirilməsi ilə təmin edir, model parametrləri user qənaət / model dövlət bərpası üçün ODE inteqratorları, routines daxildir, və CESE qalan idarə edəcək.
CESE öz & # 65533 mürəkkəb proqramlaşdırma çərçivəsində yaratmağa çalışır deyil, əksinə, əsas Java API istifadə edir. Məsələn, modellər JavaBeans dəqiqləşdirilməsi uyğun Java komponentləri var. Biz clamping əmrləri müəyyən etmək XML istifadə və Java obyekt serialization / qazanc model parametrləri bərpa etmək.
Bu Release Yenilikler:

Oxşar proqram

Nipype
Nipype

20 Feb 15

iqr
iqr

14 Apr 15

Geliştirici digər proqram Sergey Missan

CESE
CESE

21 Sep 15

Şərh Cell Electrophysiology Simulation Environment

Şərhlər tapılmadı
Şərh əlavə
Images yandırın!