The Chemistry Development Kit

Software screenshot:
The Chemistry Development Kit
Software ətraflı:
Version: 1.5.13 Yenil?nib
Tarixi Upload: 26 Apr 16
Geliştirici: The CDK Project
Lisenziya: Pulsuz
Məşhurluq: 36

Rating: 3.7/5 (Total Votes: 3)

Kimya Development Kit (həmçinin CDK kimi tanınan) bir platform-müstəqil, sərbəst paylanmış və açıq mənbə kitabxana proqram xüsusilə struktur bioinformatika, cheminformatics və hesablama Kimya Java həyata və nəzərdə tutulmuşdur.

Layihə kodu yeniden zaman və səy bir çox saxlamaq istədiyiniz proqramçılar üçün xüsusi uyğun müxtəlif faydalı alqoritmlər və data strukturları ibarətdir. Kimya Development Kit son istifadəçilər tərəfindən istifadə üçün nəzərdə deyil.


Bir baxışda Features

Açar funksiyalar oxumaq üçün dəstək və yazı kimyəvi data formatları dəstək QSAR kimyəvi strukturları dəstək göstərilməsi daxildir (Kəmiyyət strukturu & ndash; fəaliyyət əlaqələr). Descriptors, eləcə də kimyəvi graph nəzəriyyəsi dəstək üçün inşa-in alqoritmlər

Sizin rahatlığınız üçün, proqram JAR formatında pre-built binaries kimi bölüşdürülür. Sizin layihə istifadə etmək üçün, sadəcə siz də proqram & rsquo tapa bilərsiniz, yuxarıda linki istifadə edərək, Softoware son stabil versiyası download. mənbə tarball

Programmers mənbələrdən proqram tərtib haqqında ətraflı məlumat tapa bilərsiniz, müxtəlif testlər, eləcə də tar.gz arxiv içərisində yerləşir Readme.txt faylı digər proqramları istifadə etmək necə çalıştırmak üçün necə.


başlıq və dəstək OSes Under

CDK başlıq altında bir nəzər alaraq (Kimya Development Kit) software, biz Java proqramlaşdırma dili tamamilə yazılı edilmişdir ki, qeyd edə bilər.

Hal-hazırda, GNU / Linux, Microsoft Windows və Mac OS X əməliyyat sistemi 32-bit və 64-bit tatlar ilə tam uyğun gəlir. və Java Development Kit (JDK) & nbsp; Lakin, Java Runtime Environment (JRE) & nbsp tərəfindən dəstəklənən hər hansı OS işləməlidir texnologiyaları

bu azad:

  • IAtomcontainer rəsmi ittiham IMolecularFormula transfer edir
  • Sabit bug 2787332 Gasteiger pulsuz hesablanması köhnə bond array müəyyən edilib
  • SMARTSQueryTool indi Construc da TokenMgrError olarsınız səhv 2788357 düzeltmek üçün Yenilənib
  • Git repo verilən məlumata cdk.githash tag və link JavaDocs emal yeni taglet Əlavə
  • Yenilənib cdk.svnrev tags cdk.githash üçün tags
  • Bug_2787332. Triklosan molekul üçün əlavə test (Inchi = 1S / C12H7Cl3O2 / c13-7-1-3-11
  • silindi köhnəlmiş Renderer kodu: istifadə CDK-1.0.x və ya jchempaint-əsas
  • parser test suite səhv 2786624 Əlavə test
  • PMD pages Əlavə keçidlər
  • JUnit stats əlavə link
  • Pele @ gecə bağlantılar, modul dərsləri siyahısını əlavə
  • Added
  • modul HTML pages yaratmaq üçün müəyyən
  • Added
  • modul HTML pages yaratmaq üçün müəyyən

versiyası 1.5.10 yeni nədir:

  • IAtomcontainer rəsmi ittiham IMolecularFormula transfer edir
  • Sabit bug 2787332 Gasteiger pulsuz hesablanması köhnə bond array müəyyən edilib
  • SMARTSQueryTool indi Construc da TokenMgrError olarsınız səhv 2788357 düzeltmek üçün Yenilənib
  • Git repo verilən məlumata cdk.githash tag və link JavaDocs emal yeni taglet Əlavə
  • Yenilənib cdk.svnrev tags cdk.githash üçün tags
  • Bug_2787332. Triklosan molekul üçün əlavə test (Inchi = 1S / C12H7Cl3O2 / c13-7-1-3-11
  • silindi köhnəlmiş Renderer kodu: istifadə CDK-1.0.x və ya jchempaint-əsas
  • parser test suite səhv 2786624 Əlavə test
  • PMD pages Əlavə keçidlər
  • JUnit stats əlavə link
  • Pele @ gecə bağlantılar, modul dərsləri siyahısını əlavə
  • Added
  • modul HTML pages yaratmaq üçün müəyyən
  • Added
  • modul HTML pages yaratmaq üçün müəyyən

versiyası 1.2.2 yeni nədir:

  • Sabit links. Suboptimal, yol hələ bir gecə instansiya hardcoded olunur, lakin biz bütün nightlies üzərində şeyi yekunlaşdırmaq hələ XML çərçivə yoxdur (çalışan
  • Yenilənib versiyası sayı
  • IAtomContainers təmin etmək üçün əlavə test IMoleculeSet.add (IAtomContainerSet) vasitəsilə sneaked deyil
  • üzerine addAtomContainer (double IAtomContainer) də qeyri-IMolecule qəbul zaman IllegalArgumentException atmaq
  • İndi bir IMolecule deyil ki, bir IAtomContainer saxlamaq üçün cəhd bir IllegalArgumentException salır
  • # 2784182 Əlavə vahid test
  • rezerpin ilə yeni test
  • Təhlükəsizlik Threading üçün əlavə taglets
  • bir atom və ya daha az, biz lazım heç bir bölümleme var kimi, bağlı müəyyən (düzeltmelerini # 2784209, heç atomları ilə IAtomContainer on NullPointerException)
  • bug # Əlavə vahid test 2784209 hazırda uğursuz olan
  • açıq org.openscience.cdk paketi adları More qaldırılması: müddəalar salır
  • açıq org.openscience.cdk paketi adları daha çox aradan qaldırılması
  • açıq org.openscience.cdk paketi adları More çıxarılması: yeni org.openscience.cdk.Foo üçün () çağırır
  • silindi açıq org.openscience.cdk.interfaces paketləri adları (düzeltmelerini # 2783549)
  • datadebug modul org.openscience.cdk üçün idxal lehinə, açıq paketi adları silindi (düzeltmelerini # 2783549)
  • data modul org.openscience.cdk üçün idxal lehinə, açıq paketi adları silindi (düzeltmelerini # 2783549)
  • AllRingsFinder haqqında recursion seçimi breakout
  • string elementar formula Extraction pulsuz.
  • string elementar formula Extraction pulsuz.
  • kütləvi Controller Bu sıra həyata zaman

  • ağıllı bir PLANAR3 N H nin əlavə etmək üçün Yenilənib
  • giderir bug 2781199
  • səhv 2781199 Əlavə test
  • tutmaq blok ərzində CDKException konstruktor çağırır indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir
  • tutmaq blok ərzində CDKException konstruktor çağırır indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir
  • tutmaq blok ərzində CDKException konstruktor çağırır indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir
  • tutmaq blok ərzində CDKException konstruktor çağırır indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir
  • tutmaq blok ərzində CDKException konstruktor çağırır indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir
  • tutmaq blok ərzində CDKException konstruktor çağırır indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir
  • tutmaq blok ərzində CDKException konstruktor çağırır indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir
  • tutmaq blok ərzində CDKException konstruktor çağırır indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir
  • tutmaq blok ərzində CDKException konstruktor çağırır indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir
  • tutmaq blok indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir ərzində CDKException konstruktor çağırır
  • tutmaq blok indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir ərzində CDKException konstruktor çağırır
  • tutmaq blok indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir ərzində CDKException konstruktor çağırır
  • tutmaq blok indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir ərzində CDKException konstruktor çağırır
  • tutmaq blok indi yığını iz qorumaq üçün kök istisna daxildir ərzində CDKException konstruktor çağırır
  • SD sahələri bütün molekulların oxumaq təmin etmək üçün vahid test Added
  • parçalamaq test
  • Yeni fayllar
  • oxu KML üçün testlər
  • Added vahid test # 1848591 üçün yanlış Murcko çərçivə
  • Sabit cast, lazımsız tam paket adı aradan qaldırılması
  • # 2692107 Əlavə vahid test
  • Sabit typo: itkin 's'

nədir versiyası 1.2.1 yeni

  • düzgün istisna zaman salır Sabit bug 2714283, üzük düzgün bağlı deyil. bir ring müvafiq ring sayı ilə bağlıdır deyilsə, InvalidSmilesException atılır. Matches Daylight davranış
  • Sabit bug 2729120 və əlavə vahid test
  • Yenilənib comment səhv 2768643 düzeltmek üçün.
  • üçün bug 2719237. Made getBondOrderSum statik əlavə vahid test üçün qismən fix
  • Typo: proteinl - & gt; protein
  • Made class ictimai, Unbreak üçün əlavə build / *. Javafiles

  • R0 üçün uyğun
  • Qismən sabit SMARTS. Yenilənib hədəf molekul başlatma açıq R0 müəyyən zaman aydın çek etmək bir ring atomları və həmçinin yenilənir RingMembership atom göstərir. Qismən giderir bug 2587204
  • Sabit şübhəli bərabərlik test. A xüsusi üsul yalnız vasitəsilə Double obyektlərin yoxlanılması. Onlar null zaman çalışır. biz dəyəri ilə müqayisə etmək lazım bilmir. Kodu nəzərə almaq üçün yenilənir. Əlavə vahid test (və test edilə bilər ki, telefon mühafizə edilən)
  • Əlavə test üsulu annotasiya. data modulu əhatə tamamladı
  • Refactored ChiIndexUtils özəl paketi etmək. yalnız chi descriptor kodu istifadə olunur ildən, ictimai API təmizləyir. bütün asılı dərsləri yeniləndi. Daşındı test code (ehtiyacı dolu olmalıdır!), Eləcə də
  • ChiIndexUtils Məcəlləsi təmizləmə. Çevrilmiş 1.5 deyim
  • olduğunu core tamamilə əhatə olunur, belə ki, PathTools qədər təmiz və əlavə test üsulu annotasiya
  • previous cdk.keyword xətt redaktə törətmək Sabit deyil, cdk.module line
  • istifadə daha ardıcıl açar sözlər
  • Tam obyektlərin dəyəri ilə müqayisə edilir ki, təmin etmək üçün bir test əlavə daha yalnız daha
  • deserialized obyektlərin istifadə edərkən atom konteyner diffs düzgün yoxlamaq üçün test işi Əlavə
  • Bu, həqiqətən olduqca Tam obyekt istinadlar çox tam dəyəri yoxlayır ki IntegerDifference Sabit. bir obyekt disk serialized və sonra orijinal obyekt uyğun deyil deserialized vasitəsi problem giderir (yəni, qeyri boş fərq string)
  • Tətbiqi patch # 2675819 (Stefan Kuhn): Patch reactionSet bir removeReaction əlavə
  • istifadə interface əvəzinə həyata keçirilməsi
  • silindi istifadə olunmamış idxal
  • yerinə IMolecule istifadə IAtomContainer, faktiki uyğun artıq IAtomContainers istifadə kimi (düzeltmelerini # 2686249)
  • Sabit ClassCastException (düzeltmelerini # 2685134)
  • Əlavə mənbə attrib Ubuntu .deb
  • bina düzeltmek üçün
  • Sabit Help build sistemi: develjar in Doclet bankalar istifadə /; yeni src qovluq src / əsas yenilənir; rt.jar xaric çox köhnəlmiş istifadə
  • silindi libdepends
  • həqiqətən libdepends yoxdur ki, test-ioformats daxildir
  • Yenilənib belə ki, hədəf atom (məsələn, yalançı atomları kimi) heç bir simvolu var matçı (daha bir NPE çox) yalan qaytarır əgər
  • #N Sabit düzgün rəftar querys SMARTS
  • səhv 2686473 Əlavə test
  • Ant 1.7.1 Əlavə Qeyd tələb
  • Bir NPE mənbə Sabit: null == 2 "nullness üçün istisna, belə ki, ilk test səbəb
  • Sabit copyright bildiriş 2009-cu il
  • yalnız SDG modul aid layout şablon, Sabit dublikat storage, çox deyil, əlavə modul

  • git-svn / CDK ../../ of
  • Birleştirme filialı "local1.2"

versiyası 1.2.0 yeni nədir:

  • bir neçə problem təhlil smarts, iki istifadə giderir Məktubu rəmzləri və Fingerprinter ilə IPseudoAtom və yod və kükürd, 4 yeni atom növü anlayışlar edir.

versiyası 1.1.5 yeni nədir.

  • Əsasən hata düzeltmelerini

versiyası 1.1.4 yeni nədir.

  • Əsasən kiçik bugfixes

versiyası 1.1.1 yeni nədir:

  • Əsasən kiçik hata düzeltmelerini və ümumi code təmizləmək.

versiyası 1.1.0 yeni nədir.

  • Bir çox, bir çox dəyişikliklər

tələblər

  • Java 2 Standard Edition Runtime Environment

Oxşar proqram

PyVib2
PyVib2

2 Jun 15

GAMGI
GAMGI

22 Jun 18

Chemsuite
Chemsuite

3 Jun 15

gperiodic
gperiodic

3 Jun 15

Şərh The Chemistry Development Kit

Şərhlər tapılmadı
Şərh əlavə
Images yandırın!