Əsas Yerli Alignment Axtarış Tool qısa partladılması ilə mövcud ardıcıllıqla bütün asılı olmayaraq sorğu protein və ya DNT olub bazaları araşdırmaq üçün nəzərdə oxşarlıq axtarış proqramları müəyyən edilir.
Bu qlobal alignments fərqli olaraq yerli çalışır ki, Heuristic alqoritmi istifadə edir və buna görə də oxşarlıq yalnız təcrid regionlarda bölüşmək ardıcıllığı arasında münasibətləri aşkar edə bilər.
Bu tam yürütülebilir kimi yerli run bilər və özəl, yerli bazaları qarşı Blast axtarış çalıştırmak üçün istifadə edilə bilər, və ya NCBI verilənlər bazası nüsxə nazil. Bu Mac OS, Win32, Linux, Solaris, IBM AIX, SGI, Compaq OSF və HP- UX sistemləri çalışır
Bu azad Yeni nədir.
- təkmilləşdirilməsi:
- Ətraflı sənədlər, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1762 mövcud sadələşdirilmiş quraşdırma təlimatları daxildir
- Zahid verilənlər bazası hard-maskeleme üçün əlavə dəstək.
- təkmilləşdirilməsi, ardıcıllığı böyük nömrələri ilə FASTA giriş üçün makeblastdb performansını yaxşılaşdırılması səhv yoxlanılması.
- izin ver Best Hit variantları və Blast2Sequences rejimi üçün biçimlendirme XML
- psiblast üçün çox sorğu ardıcıllığı imkan verir.
- -in_msa psiblast arqumenti ilə master kimi hər hansı bir çox sequence alignment ardıcıllıqla dəqiqləşdirilməsi imkan verir.
- makeblastdb üçün isteğe -input_type dəlil əlavə edin.
- cədvəlli çıxış sorğu və mövzu uzunluğu üçün əlavə dəstək.
- -seqidlist mübahisə Performans yaxşılaşmışdır.
- təsviri və alignments sayı minimum artıq cədvəlli və XML çıxış (older blastall proqram davranışı ilə ardıcıl) üçün istifadə olunur.
- Bug giderir:
- Makeblastdb və təhlil ilə blastdbcmd problemləri, saxlanılması və ardıcıllıqla tanımlayıcıları almaq.
- cədvəlli çıxdı itkin mövzu tanımlayıcıları.
- Blast_formatter məhəl -num_alignments və -num_descriptions
- Blast arxiv format çox sorğu ilə yanlış xilas ola bilər.
- Blast_formatter bir gereksiz şəbəkə bağlantısı yaradılmışdır.
- Blast_formatter düzgün məlumat maskeleme xilas etmədi.
- Rpstblastn avariya bilər bir çox ardıcıllığı axtarış.
- Yönümlü megablast multi-yivli rejimində çalışır deyil.
- psiblast xilas PSSM Sorgun adı saxlanılır deyil.
- Çox sorğu və ya böyük verilənlər bazası ardıcıllığı ilə çox yivli rejimində çalışması mümkün uğursuzluq.
- Tblastn oyunları buraxa bilər verilənlər bazası maskeleme ilə çalışır.
- defline əlavə fəzalarında ilə ardıcıllığı giriş üçün kesilir çıxış
- MacOSX 10.5-də MacOSX binaries ilə Problem
versiya 2.2.24 yeni nədir:
- standartlarına yeniden biçimlendirmeyi icazə Zahid Arxiv format təqdim tək partlayış blast_formatter ilə axtarış.
- Bu Blast bazaları tərcümə mövzu yumşaq maskeleme dəstək verir.
- Bu Zahid Trace geri əməliyyatları (btop) çıxış format dəstək verir.
- Bu mövcud Blast verilənlər bazası siyahı üçün blastdbcmd üçün command line variantları edir.
- uzaq Zahid axtarış biçimlendirme Təkmilləşdirilmiş performans. Yaddaş şərtlərinə həyata üçün ardıcıl çıxış kodu istifadə edir.
- Çox yer ayrılmış Blast məlumat bazaları ilə dizine megablast bir səhv üçün bir düzeltme.
versiyası 2.2.19-ci ildə Yeni nədir:
- BLASTDB mühit dəyişən indi dəstəkləyir çox verilənlər bazası axtarış yolları . Mümkün, kiçik protein axtarış masa performansını yaxşılaşdırılması üçün istifadə olunur.
- formatrpsdb indi 2G çox verilənlər bazası böyük yaradılması dəstəkləyir.
- seedtop indi gi siyahıları ilə axtarış dəstəkləyir.
- blastn üçün X3 dəyər / megablast korrektə edilib.
Şərhlər tapılmadı