PANAMA

PANAMA Python yazılı eQTL işlər, bu confounding amillər hesab üçün bir roman ehtimal model.
Belə müşahidə olunmayan satan və ya naməlum incə ekoloji tedirginlikler kimi gizli confounding amillər, saxta saxta assosiasiyalar yaratmaq və ya real genetik dərnək siqnalları örtə bilər. Əvvəlki üsulları fərqli olaraq, PANAMA birgə görkəmli genetik tənzimləyici təsiri ilə gizli amillər öyrənir. Nəticədə, bu yeni model daha dəqiq confounding variasiya əsl genetik dərnək siqnalları ayırt edə bilərsiniz.
N. Fusi, Ç. Stegle və ND Lawrence, 2012, PLoS Computational Biologiya "confounding amillər və görkəmli genetik tənzimləyiciləri birgə modelləşdirmə artması genetik Genomik işlərdə dəqiqliyi təmin edir"
Daha məlumatlar http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html

Requirements:

• Python