SPInDel workbench

Software screenshot:
SPInDel workbench
Software ətraflı:
Version: 1.0.1
Tarixi Upload: 27 May 15
Geliştirici: GEPO
Lisenziya: Pulsuz
Məşhurluq: 39
Boy: 19934 Kb

Rating: 1.0/5 (Total Votes: 2)

Spindel ribosomal RNT (rRNA) gen regionlarının uzunluğu əsasında bioloji identifikasiyası üçün alternativ yanaşmadır. Ümumiyyətlə, müxtəlif növ əsas rRNA gen ardıcıllığı alignments, həm də nukleotid Əvəzedicilərimiz baxımından (adətən "SNPs" adlanır) və durub / silinməsi (INDEL) hadisələr nukleotid qorunması və variasiya alternativ regionları göstərir. "-" müxtəlif uzunluqlu ardıcıllığı indels nəticələrin olması və adətən bir tire ilə qeydi alignment boşluqlar, təqdim edir.
Mühafizə rayonlarında dəyişən seqmentləri ardıcıllıqla bir birləşməsi hər növ (bir "Spindel profil") xarakterikdir uzunluğu olan ("Spindel hypervariable regionlarda") müəyyən etmək üçün istifadə olunur aşağıdakılardır: bioloji identifikasiyası üçün bizim konsepsiyası rRNA gen ardıcıllığı istifadə edir. Belə ki, hər növ unikal rəqəmli profil ilə müəyyən edilə bilər.
Nəzəri olaraq, 20 alleller hər (və ya 5 alleller hər 11 regionunda) ilə yalnız 6 hypervariable rayonun bir sorğu sıra 5 milyon arasında və 15 olduğu təxmin edilən dünyadakı bütün ökaryotik növ ayrı-seçkilik etmək kifayətdir. Təcrübədə, Spindel aşağı intraspecific variasiya və yüksək filogenetik qətnamə ilə ökaryotik növlərinin 93,3% ayrı-seçkilik edə bilər.

Desteklenen əməliyyat sistemləri

Oxşar proqram

Şərh SPInDel workbench

Şərhlər tapılmadı
Şərh əlavə
Images yandırın!