ZOOM Lite

ZOOM Lite bir nəsil sequencing data Xəritəçəkmə və vizual proqramdır. Kimi İstifadəçilər giriş arayış genofondunun və Illumina / Solexa qısa faylları oxuyur və ya AB bərk rəng alan müxtəlif formatlarda faylları oxuyur * .fasta * .fastq * _seq.txt * .csfasta və s. ZOOM bu qısa mapping nəticələri nəticələr istinad ardıcıllığı haqqında deyilir. ZOOM Lite yeni dizayn çox aralıklı toxum nəzəriyyəsi əsasında sürətli və dəqiq mapping kernel var. 240bp üçün 15bp idarə edilə bilər, həm də bir-end və qoşalaşmış-end müxtəlif uzunluqlu deyilir. Uyğunsuzluqdan və oxu və arayış ardıcıllıqla onun hədəf regionda arasında müxtəlif uzunluqlu bir durub / silinməsi hər hansı bir sayı icazə verilir. Hər oxumaq üçün unikal eşlenen nəticələr və ya ən yaxşı (top N) nəticələri minimal uyğunsuzluqdan və INDEL uzunluğu görə məlumat veriləcək. Quality puanları mapping düzgünlüyünü artırmaq üçün istifadə olunur. Mapping kernel əsasında ZOOM Lite istifadəçilər, yerli oxumaq məlumat və arayış ardıcıllıqla data yüklemek dörd CPU'lar arasında paralel olaraq müvafiq parametrləri, proses yüksək səs data seçin çalışan vəzifələri nəzarət mapping nəticələri saxlamaq üçün imkan verir qrafik keçirmək ya mapping nəticələri və çıxış mapping nəticələri * .Yataq və ya daha UCSC browser track məlumat tetkiği üçün * .GFF fayl formatları. Xəritəçəkmə nəticələri deyilir arasında ətraflı ardıcıllığı alignments bütün bir xromosom üzərində oxu dərinliyi graph, istənilən miqyasda görüntülenen və arayış ardıcıllıqla bilər. İstifadəçilər asanlıqla sadəcə klik və drag və ya scrolling vasitəsilə maraq rayonlarında gedin. ZOOM Lite ZOOM Studio proqram törəmə

Bu azad Yeni nədir.

Version 1.5 SAM ixrac format, memarlıq tənzimləmək, daha yaxşı kodu optimallaşdırılması daxildir kiçik Daha yaxşı performans üçün proqram ikili ölçüsü, və təkmilləşdirilmiş dabase engining.