CaPSID

Insan genofondunun və transcriptomes və xarakteristikası querying, bir ölçeklenebilir nəticələr bazası və idarə olunması üçün bir istifadəçi dostu web-based proqram təminatı ilə birlikdə

capsid hərtərəfli açıq mənbə patogen ardıcıllığı müəyyən & nbsp üçün yüksək-performance hesablama boru kəməri inteqrasiya platforma və nəticələri görselleştirilmesi.
Başlarken
Siz Python 2.6+ quraşdırılması və Apache Tomcat 6 + bir MongoDB bazası lazımdır. Daha ətraflı məlumat üçün, wiki oxumaq:

• giderir: http://wiki.github.com/capsid/capsid/home

  What Bu azad yeni Hata beledir toplama işlemi və alignment çalışan aşkar deyil

• uzun çalışan sorğu təyinat daha çox iş

nədir versiya 1.4.2-ci Yeni

• rədd MongoKit asılılıq

nədir versiya 1.4.1 Yeni

• uzun çalışan statistika sorgular üçün giderir kursor fasiləsi

nədir versiya 1.4.0-ci Yeni

• onlar bütün çox run olunur isə edər statistika sonunda
• uid kimi gen üçün unikal id saxlayır

versiya 1.2.7 yeni nədir:

• giderir README

nədir versiya 1.2.6-ci Yeni

Subtraction eşlenen bina zaman unmapped

Versiya 1.2 yeni nədir:

• unmapped deyilir FastQ faylları yaratmaq üçün Utility
• Utility FastQ faylları kəsişməsində qayıtmaq
• Utility filter FastQ faylları qayıtmaq
• Added mapq ərəfəsində bayrağı üçün toplama işlemi
• Gbloader artıq bakteriya və göbələk genofondunun yükləyə bilər
• GridFS istifadə verilənlər bazası genomu ardıcıllığı saxlayır
• HE yaddaş iz statistika hesablanması zamanı
• istifadə Subprocesses yerinə os.system bir
• mapq puanları filter 0
daxil etmək lazımdır

nədir Versiya 1.1 Yeni

• cüt sonuna dəstək deyilir edər

versiya 1.0.1 yeni nədir:

• MongoDB identifikasiyası üçün əlavə dəstək

tələblər

• Python