Üst Bioinformatika üçün Linux

AHREA nisbi ifadə tapmaq asan Şagirdlər edir ki, bir proqram suite edir. . Bu Python yazılı tələblər ...

AREM bir (çip-Seq data Model Based təhlili) Macs əsaslanır.Xromatin immuno- yağıntı (çip-Seq) coupled yüksək ötürücülük sıralama geniş genomu-geniş transkripsiyası amillər cofactors, Xromatin modifikatorların, və digər DNT məcburi zülal məcburi nümunələri...

. CWC Simulator C ++ Cwc, nümayəndəlik və bioloji sistemlərin simulyasiya & nbsp üçün calculus həyata keçirilməsi; uğurlu quraşdırma (QURAŞDIRMAQ bax) sonra bəzi nümunələr göstərilir kimi, CWC modelləri üzərində simülasyonları run edə bilərsiniz (/...

Syntainia çox genofondunun vizual üçün yenilikçi proqram & nbsp;. Bu gen qrupları arasında əlaqələri keçirmək və manipulyasiya üçün sadə və intuitiv istifadəçi interfeysi təqdim edir. Aydın gen vizual ilə, bir çox genofondunun arasında synteny...

checkmyclones Sanger sıralama nəticələri & nbsp yoxlamaq üçün alətlər təmin edən bir proqramdır. (Koordinatları daxil olmaqla) hər hansı ağlabatan formatda təqdim (və ya hər hansı düz mətn və ya FASTQ files) istinad ardıcıllığı bir sıra qarşı tələblər ...

tigreBrowser tigre R paketi nəticələr üçün bir gen ifadə model browser edir (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Quraşdırma tigreBrowser Python versiyası> = 2.5 tələb edir. tigreBrowser aşağıdakı komanda ilə quraşdırıla...

picme proqramları qiymətləndirmək və böyük Kümeleri üçün phylogenetic məlumatlılıq sahəsi olan bir Python paketidir. Quraşdırma Bu an üçün, proqram yüklemek üçün en asan yoludur:git klon git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / path / üçün / picmeTest...

tapir proqramları qiymətləndirmək və böyük Kümeleri üçün phylogenetic məlumatlılıq sahəsi olan bir Python vasitədir. istinad tapir Tapir istifadə edərkən, istinad edin:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapir filogenetik məlumatlılıq yüksək ötürücülük...

ADDIM özbaşına kompleks 3D geometrileri reaksiya-diffuziya sisteminin dəqiq stoxastik simulyasiya üçün bir paketidir. Bizim əsas simulyasiya alqoritm Gillespienin SSA bir təzahürüdür, 3D tetrahedral mesh elementləri üzərində molekulların yayılması ilə...

NEO (Sinir Ensemble Objects) və birlikdə daha yaxın oxşar qol ilə OpenElectrophy, NeuroTools və bəlkə digər layihələr almaq məqsədi ilə, sinir analiz istifadə etmək üçün baza dərsləri ümumi set təmin etmək üçün bir layihədir.İki böyük vəzifələr bu günə...