ADDIM özbaşına kompleks 3D geometrileri reaksiya-diffuziya sisteminin dəqiq stoxastik simulyasiya üçün bir paketidir. Bizim əsas simulyasiya alqoritm Gillespienin SSA bir təzahürüdür, 3D tetrahedral mesh elementləri üzərində molekulların yayılması ilə məşğul uzadılmışdır.
Əsasən dendrites və synapses ətrafında nöronal siqnal yollar ətraflı modelləri simülasyonu üçün hazırlanmış baxmayaraq, ümumi vasitədir və məkan künclərinə və morfologiya rol oynadığı düşünülür olan hər hansı biokimyəvi cığır öyrənilməsi üçün istifadə edilə bilər.
Biz ADDIM istifadəçilər model yaradılması bir mesh yaradan, simulyasiya və yaradan nəzarət və çıxış analiz bütün aspektləri nəzarət Python skript istifadə edə bilərsiniz deməkdir Python modulları bir sıra kimi addımlar həyata keçirdik. əsas hesablama routines hələ icra maksimal sürəti C / C ++ məsləhət modulları həyata keçirilir.
. STEPS GPL v3 lisenziya altında paylanan
tələblər
- Python
Şərhlər tapılmadı