misopy

MISO (isoforms qarışığı) ifadəsi səviyyəsi & nbsp quantitates Python yazılmış bir ehtimal çərçivəsində, RNT-Seq məlumatlar alternativ spliced ​​gen, və nümunələri arasında differentially tənzimlənən isoforms və ya exons müəyyən edir.
RNT-seq da isoforms hasil olunur deyilir tərəfindən generative prosesi modelləşdirilməsi ilə, MISO model bir oxu xüsusi Isoform mənşəli ehtimalını hesablamaq üçün Bayesian nəticəçıxarma istifadə edir.
MISO alternativ mRNA isoforms əsas dəsti abundances quantitate üçün isoforms üçün deyilir inferred təyin edir. Artıq hesablanmış Confidence intervalları qiymətləndirmələrin etibarlılıq sayısal ki, əldə edilə bilər.
MISO dərslik və sənədləşdirilməsi üçün http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ baxın

tələblər .

• Python