Pathomx

Pathomx (əvvəlki MetaPath) vizual və GNU / Linux və digər POSIX & nbsp altında metabolik məlumatların təhlili üçün interaktiv kommunal kimi çıxış üçün yer qədər nəzərdə IPython, Qt və PyQt həyata açıq mənbə qrafik proqramdır; əməliyyat sistemləri. Bu ilkin idxal və NMR normallaşması, binning və alignment, eləcə də metabolik cığır vizual və dağ-mədən, o cümlədən (Nüvə maqnit rezonansı) data, spektrlərinin emalı, ixrac üçün dəstək daxildir glanceKey xüsusiyyətləri metabolomics data.Features emal üçün istifadə olunacaq dizayn edilmişdir. Siz həmçinin müəyyən yolları vizual müxtəlif marşrutları vasitəsilə genom və metabolomics data idxal edə bilər.
Müxtəlif MetaCyc bazası notları də verilənlər bazası birləşməsi bağlantılar, eş, eləcə də əlaqədar yollar və reaksiyalar qeyd edə bilər arasında Pathomx tətbiqi daxil edilir. MetaCyc bazası ictimai API irəli gəlir ki, unutmayın.
Ərizə sürətli kompleks Kümeleri kəşfiyyat, genişlənən sayəsində və yapılandırılabilir plugins üçün güclü MetaCyc verilənlər bazası istifadə edir. Bundan əlavə, Matplotlib şəkil üçün, NMR data idxal nmrglue, interaktiv qrafik üçün d3.js, user sayına görə NumPy və Scipy kitabxana istifadə edir və statistik analiz methods.Under başlıq üçün scikit öyrənmək və başlıq altında OSesLooking dəstəklənir Pathomx, biz tətbiqi IPython shell inşa edilmişdir ki, qeyd edə bilər. Bu da pre-built ikili paketləri kimi download üçün mövcud olan Microsoft Windows və Mac OS X əməliyyat sistemi altında yaxşı işləyir. GNU / Linux üçün proqram yalnız 32-bit və 64-bit hardware platformaları ilə uyğun zip'lenmiş mənbə arxiv bölüşdürülür.
Pathomx istifadə edərkən, istifadəçilər tətbiq BioCyc ailə hissəsidir MetaCyc cığır bazası özü məlumatların istifadə edir ki, yadda saxlamaq lazımdır. MetaCyc API yerli saxlanılır təchiz bazası yaratmaq üçün istifadə olunur

Bu azad Yeni nədir.

• A tamamilə yeni drag-drop vizual redaktoru əlavə edildi.
• Bu, iş daxil alətləri sürükleyerek alətləri arasında məlumat xətləri sürükleyerek əlaqələri redaktə və cari emal ümumi almaq üçün inline views istifadə edərək, analiz axınları yaratmaq imkan verir.
• Data ani idxal üçün iş daxil düşmüşdür bilər.
• Bu da başına alət reports, barlar, və statusu göstəriciləri tərəqqi canlı əlavə edib.
• Səhvlər yardım mətn ilə qeyd olunur (alətlər üzrə Araç ipuçlarını qırmızı göstərilir zaman).

tələblər

• Graphviz