BioRuby

BioRuby Biyoenformatik üçün vahid mühit (Biologiya İnformatika) təmin edir.
S, web xidməti, o cümlədən kitabxanaların geniş və s.; Obyekt yönümlü scripting dili Ruby bioinformatika tədqiqat üçün uyğun bir çox xüsusiyyətləri, məsələn, aydın sintaksis kimi Perl kimi güclü & rsquo mürəkkəb obyektlərin, mətn user üçün normal ifadeler ifadə var
Ruby syntax sadə və çox təmiz kimi, biz bu proqram geliştiriciler üçün başlayanlar üçün öyrənmək üçün asan bioloqlar üçün istifadə etmək asan, həm də kifayət qədər güclü olduğuna inanıram.
BioRuby, geliştirici düz faylları, internet web server və yerli relational verilənlər bazası bioloji bazası entries qəbul edə bilərsiniz.
Bu verilənlər bazası entries sizə lazım olan məlumat çıxarış ayrıştırılan bilər. Bioloji ardıcıllığı Ruby & rsquo yerinə üsulları ilə müalicə edilə bilər; s String sinif və normal ifadeler ilə.
kitabxana Blast, FASTA, HMMER və bioloji analiz üçün bir çox digər proqram paketləri kimi alətləri ilə inteqrasiya oluna bilər.
 BioRuby əsas bioloji bazası formatları dəstəkləyir və flatfile endeksleme, SQL, web xidmətləri və s. KEGG API daxil olmaqla, müxtəlif web services asanlıqla BioRuby tərəfindən istifadə edilə bilər vasitəsilə daxil olmaq üçün bir çox yolları təmin edir.

Features :

• BioRuby shell
• API
• Documentation

tələblər

• Ruby 1.8.7 və ya daha yüksək