Biopython

• Yeni modulu Bio.bgzf oxu və yazı BGZF faylları (dəstəkləyir Ban GNU Poçt Format), səmərəli təsadüfi çıxışı ilə GZIP bir variant, ən çox BAM formatında və tabix hissəsi kimi istifadə olunur.
• Genbank / embl parser indi tanınmamış xüsusiyyət yerlərdə xəbərdarlıq vermək və (Yox kimi xüsusiyyət yerini tərk) təhlil davam edəcək.
• Bio.PDB.MMCIFParser indi default tərəfindən tərtib (lakin hələ Jython, PyPy və ya Python 3 altında mövcud deyil) edir.

versiya 1.59 yeni nədir:

• Yeni modulu Bio.TogoWS TogoWS REST üçün banderol edir API.
• NCBI Entrez Fetch funksiyası Bio.Entrez.efetch EFetch 2.0 çox ID dəlilləri NCBI nin ciddi rəftar idarə etmək üçün yeniləndi.

nədir versiya 1.58 Yeni

• PAML üçün yeni interfeys və parsers (filogenetik təhlili ilə Maksimum Ehtimal) proqramları paketi dəstək codeml, baseml və yn00, eləcə də chi2 bir Python yenidən həyata Bio.Phylo.PAML modulu kimi əlavə edilmişdir.
• Bio.SeqIO İndi oxumaq ABI fayllar üçün dəstək daxildir (& quot; Sanger & quot; kapilyar sıralama iz faylları, Phred keyfiyyətləri ilə olan adlı ardıcıllıqla)
.
• Bio.AlignIO & quot; Fasta-m10 & quot; Bill Pearson FASTA versiyası 3.36 istifadə olunan parser marker xətləri öhdəsindən gəlmək üçün yeniləndi.

versiya 1.57 yeni nədir.

• Biopython indi tırtıl ilə quraşdırıla bilər

versiyası 1.56-ci ildə Yeni nə:

• Bio.SeqIO modulu dəstək yeniləndi protein embl (patent verilənlər bazası üçün istifadə olunur) faylları (Uri Laserson köməyi ilə embl formatında bir variant) IMGT faylları, və Uniprot XML faylları.

nədir versiya 1.55 Yeni

• iş bir çox vasitəsilə (Python 3 dəstək istiqamətində olmuşdur 2to3 script), lakin bir şey qırdı halda hər hansı bir dəyişiklik fərq olmamalıdır.
• yeni funksiyalar baxımından, ən çox diqqət çəkən məqamı command line alət proqram banderol dərsləri daha asan xarici alətləri zəng etmək lazımdır ki, indi çalıştırılabilir ki.

tələblər

• Python 2.6 və ya daha yüksək