E-Cell System

E-Cell sistemi kompüter virtual hüceyrələri tikintisi bir anlayışdır.
E-Cell sistemi modelləşdirmə, modelləşdirmə, və bioloji hüceyrələr, Kouichi Takahashi tərəfindən architected və developers bir gözəl komanda tərəfindən yazılı olaraq geniş miqyaslı kompleks sistemlərin təhlili üçün bir obyekt-yönümlü proqram suite edir. Sistemi, E-Cell Simulation Ətraf versiyası 3, əsas hissəsi arada müxtəlif timescales çox alqoritmlər idarə çox komponentləri imkan verir.
E-Cell Project dəqiq bütün mobil simulyasiya imkan zəruri nəzəri dəstəkləyir, texnologiyaları və proqram platformalarını inkişaf yönəlmiş beynəlxalq tədqiqat layihəsidir.
E-Cell sistemi aşağıdakı üç əsas hissədən ibarətdir:
- E-Cell Simulation Environment (və ya E-Cell SE)
- E-Cell modelləşdirilməsi Environment (və ya ME E-Cell)
- E-Cell təhlili Toolbar

Features

• Əsas imkanları:
• Obyekt yönümlü modelləşdirmə və mürəkkəb sistemlərin simulyasiya.
• Plug-in memarlıq. Yeni istifadəçi obyekt dərsləri, inkişaf dinamik dolu, və simulyasiya istifadə edilə bilər.

Simulyasiya zamanı
• Real-time istifadəçi qarşılıqlı və vizual.


• Scripting:
• simulyasiya sessiyasının Python scripting (run / stop / parametri manipulyasiya / data ... və s emal).
• simulyasiya sessiyanın çox çalışır daxildir simulyasiya təcrübə Python scripting (məsələn, parametri tuning, metabolik nəzarət təhlili və s kimi ..)
• model fayl nəsil Python scripting (verilənlər bazası avtomatlaşdırılmış model tikintisi üçün məsələn).


• uyumlulukları:
• SBML səviyyəsi 1/2 idxal.
• SBML səviyyəsi 1/2 ixrac.


• Paralel hesablama:
• Paylaşılan yaddaş, bir simulyasiya sessiyasının çox mövzu paralelləşdirilməsi. (Əsas filialı birləşdi olunacaq.)
• Cluster və grid çox simulyasiya sessiyanın hesablanması payladı. Sun Grid Engine (Globus Toolbar).

Bu azad yeni nədir.

• Bu versiya müxtəlif bugfixes əlavə

versiyası 3.1.107 RC2 yeni nədir: ecell.Session.saveLoggerData da

• Sabit bug (). (Moriyoshi)
• ecell.ECDDataFile bir səhv Sabit. (Moriyoshi)

nədir versiyası 3.1.107 RC1 Yeni

yeni GCC (və GT

• Sabit yığma problem; = 4.3). (Moriyoshi)
• pyecell daxil Integrated pyecs. (Moriyoshi)

Ecell.ecs daxil
• birləşdi ecell.emc (Mac OS X daxil olmaqla) bir platforma statik initializer weirdness qarşısını almaq üçün. (Moriyoshi)
• iki GUI Önuçlar (seans monitor və model-redaktoru) python modulları, ecell.ui.osogo və ecell.ui.model_editor iki paketləri olmaq yeniləndi. (Moriyoshi)
• ecell / Ön / session_manager yaşayır ecell.ui.osogo.GtkSessionMonitor yeri qazandı GtkSessionMonitor. (Moriyoshi)
• ecell.SessionManager ecell.session_manager adını. (Moriyoshi)
• ecell.ecs_constants aşağıdakı sabitləri silindi. (Moriyoshi)