Yaxşı Bioinformatika üçün Linux
. Bir MongoDB bazası üst bir abstraksiya qat kimi MetagenomeDB akt MetagenomeDB asanlıqla & nbsp saxlamaq almaq və metagenomic ardıcıllığı annotasiya yazmaq üçün nəzərdə tutulmuşdur bir Python kitabxana var. Bu obyektlərin, yəni ardıcıllığı və...
. SSuMMo cinsə mənsub ardıcıllığı təyin etmək HMMER istifadə edərək ətrafında iteratively nəzərdə funksiyaları & nbsp bir kitabxana, nəticələri göstərir ki icma daxilində növ / növlü bölüşdürülməsi göstərən yüksək not ağacları var.Mənbə kodu ilə daxil...
tigreBrowser tigre R paketi nəticələr üçün bir gen ifadə model browser edir (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Quraşdırma tigreBrowser Python versiyası> = 2.5 tələb edir. tigreBrowser aşağıdakı komanda ilə quraşdırıla...
MACS2 çip-Seq məlumat üçün model əsasında analiz vasitədir.Sequencing texnika təkmilləşdirilməsi ilə Xromatin immunoprecipitation yüksək ötürücülük sıralama izlədi (çip-Seq) genomu-geniş protein-DNA qarşılıqlı öyrənmək üçün məşhur olur. Güclü çip-Seq...
edittag platforma xüsusi sequencing adapterləri və PCR astar üçün ardıcıllıqla tags redaktə metrik ardıcıllıqla tags dəstləri dizayn redaktə metrik üçün uyğunlaşdırılması üçün ardıcıllıqla tags yoxlanılması və inteqrasiya üçün bir proqram toplusudur....
MacMolPlt 3-D molekulyar strukturları və normal rejimi (vibrasiya) hiylələri üçün müasir qrafik proqramdır. Modern...
picme proqramları qiymətləndirmək və böyük Kümeleri üçün phylogenetic məlumatlılıq sahəsi olan bir Python paketidir. Quraşdırma Bu an üçün, proqram yüklemek üçün en asan yoludur:git klon git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / path / üçün / picmeTest...
SyntenyMiner görüntüləmək və bir çox tam genomu ardıcıllığı arasında müqayisə dindirmək üçün bir proqram. interface istinad genomu ardıcıllıqla matç naviqasiya görünüşü təmin edir. Müxtəlif genofondunun xromosom daha inversions, insertions / əhatəsindədir...
ProteinShop protein strukturları manipulyasiya üçün interaktiv vasitədir. Bu tez insan bilik və intuisiya istifadə protein konfiqurasiyaları bir sıra yaratmaq üçün nəzərdə tutulmuşdur. Bu konfiqurasiyaları yerli və ya qlobal optimallaşdırma edilə bilər....
PySCeS Molekulyar Cell fiziologiyası & nbsp üçün Triple-J Qrupu tərəfindən hazırlanmış bir layihədir,. Model cəhd və yaşayış hüceyrə etmək mürəkkəb prosesləri və sistemləri anlamaq üçün Features . A mətn based model təsviri dili A struktur təhlili...