mpiBLAST NCBI Blast bir MPI əsasında paralel təzahürüdür. Layihə formatdb əvəz və quraşdırılmış MPI ilə kompüter bir qrup paralel olaraq partladılması iş icra versiyaları ilə blastall proqramları bir cüt ibarətdir. Ənənəvi partladılması qarşı mpiBLAST istifadə edərək iki əsas üstünlükləri var.
Birincisi, mpiBLAST çoxluq hər node daxilində bazası olur. Verilənlər bazası hər node seqment, çünki kiçik it adətən disk I / O aradan qaldırılması üçün əhəmiyyətli speedup verir, bufer-cache yaşamaq olar. İkincisi, Prosessorlararası rabitə tələbləri aşağı olduğundan Zahid users səmərəli, ucuz Beowulf qruplar istifadə etmək üçün imkan verir.
mpiBLAST bazası RAM uyması üçün çox böyük hallarda super-xətti speedup verir, və digər hallarda xətti speedup yaxın. Bu xüsusi çoxluq tələb etmir.
Tələblər:
Şərhlər tapılmadı