Yeni Bioinformatika üçün Linux
ADDIM özbaşına kompleks 3D geometrileri reaksiya-diffuziya sisteminin dəqiq stoxastik simulyasiya üçün bir paketidir. Bizim əsas simulyasiya alqoritm Gillespienin SSA bir təzahürüdür, 3D tetrahedral mesh elementləri üzərində molekulların yayılması ilə...
NEO (Sinir Ensemble Objects) və birlikdə daha yaxın oxşar qol ilə OpenElectrophy, NeuroTools və bəlkə digər layihələr almaq məqsədi ilə, sinir analiz istifadə etmək üçün baza dərsləri ümumi set təmin etmək üçün bir layihədir.İki böyük vəzifələr bu günə...
OpenElectrophy manipulyasiya, saxlanması və elektrofizyolojik məlumatların təhlili asanlaşdırmaq üçün bir çərçivə. Bir çox müxtəlif fayl formatları data idxal və bir SQL tipli verilənlər bazası onları saxlaya bilərsiniz.OpenELectrophy daxil analiz...
PEAT, ele proqnozlaşdırılması və zülalların biofiziki xüsusiyyətləri təhlil üçün proqramlar bir suite edir.Sənədləşdirmə, təlimat, ekran və s http://enzyme.ucd.ie/PEAT bax tələblər . ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) insan genomu kimi uzun istinad ardıcıllıqla qarşı nisbətən qısa nukleotid ardıcıllığı aligns səmərəli proqramdır.proqram iki alqoritmlər, bwa qısa və BWA-SW həyata keçirir. sorğu üçün köhnə əsərləri 200bp daha qısa və...
. SSuMMo cinsə mənsub ardıcıllığı təyin etmək HMMER istifadə edərək ətrafında iteratively nəzərdə funksiyaları & nbsp bir kitabxana, nəticələri göstərir ki icma daxilində növ / növlü bölüşdürülməsi göstərən yüksək not ağacları var.Mənbə kodu ilə daxil...
xulu ikili faylların oxumaq üçün Python API Goby növbəti-gen data idarə çərçivəsində istifadə yaradılmışdır.Adətən, bu directory tam Goby paketinin bir hissəsi, mövcud kimi gəlir:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/tam paketi Java mənbə kodu daxildir....
PySCeS Molekulyar Cell fiziologiyası & nbsp üçün Triple-J Qrupu tərəfindən hazırlanmış bir layihədir,. Model cəhd və yaşayış hüceyrə etmək mürəkkəb prosesləri və sistemləri anlamaq üçün Features . A mətn based model təsviri dili A struktur təhlili...
. Pysam oxu və Samfiles manipulyasiya & nbsp üçün Python modulu edir; Bu samtools C-API yüngül banderol var.Tez Başlanğıc kitabçası burada. Daha ətraflı sənədlər burada mövcuddur.Suallar və şərhlər çox açıqdır və...
. TRMiner bir Python elmi məlumatlar kuratorların məqsədi kommunal & nbsp edir; sürətlə bir mədən məqsəd üçün müvafiq cümlələr elmi əsərlərin böyük kolleksiyalar kesmek üçün imkan verir.Bu iki addımlar əldə edilir. Birincisi, mətnlər müvafiq sözlər üçün...